Chương 1: Sinh nhật buồn nhứt
Cuốn sách bắt đầu vào buổi sáng sinh nhật của Harry. Bộ phim bắt đầu vào buổi tối trong chuyến viếng thăm của Masons, bỏ qua Dobby trong hàng rào và những cuộc cãi vã giữa Harry và gia đình Dursley. Vernon nói rằng họ đã quan tâm đến Harry từ khi cậu ấy còn là một đứa trẻ, cho cậu ấy đồ ăn ngon và cho cậu ấy thêm phòng ngủ của Dudley. Ở phân cảnh này bộ phim ngụ ý rằng việc Dursley đưa phòng ngủ cũ của Harry Dudley xảy ra sau năm đầu tiên của cậu ở Hogwarts, khi cậu thực sự được cho phòng ngủ ngay trước năm học mới của Harry trong cuốn sách trước đó để ngăn cản những lá thư nhập học đến với Harry.
Chương 2: Lời cảnh báo của Dobby
Trong phim Dobby đã điều khiển làm cho chiếc bánh bay vào phòng khách và thả nó lên đầu bà Mason. Tuy nhiên, trong sách, chiếc bánh pudding do Dobby đánh rơi trong bếp, khiến nó phát nổ và văng tung tóe khắp người Harry chứ không phải bà Mason.
Và lý do và Masons bỏ về trong phim là do chiếc bánh rơi vào người bà khiến bà vô cùng tức giận nhưng trong sách bà ấy bỏ về là do bà Mason cảm thấy sợ khi có một con cú do Bộ Pháp thuật cử đến nhà Dursley liên quan đến sử dụng bất hợp pháp Bùa lơ lửng.
Một cảnh bị cắt đó là Bộ gửi thư khiển trách Harry vì đã vi phạm Nghị định về việc hạn chế phép thuật vị thành niên và thông báo cho nhà Dursley về quy định này. Điều này giải thích trong phần phim sau rằng Vernon Dursley đã biết rằng Harry không được phép biểu diễn phép thuật bên ngoài trường học. Vì cảnh này không được đưa vào bộ phim, nên nó đã gây ra nhiều khúc mắc trong các phần phim sau
Chương 3: Trang trại Hang sóc
Trong sách, chiếc hòm của Harry bị khóa trong tủ dưới cầu thang và Fred và George phải lẻn vào nhà và lấy chìa khóa của cả phòng và tủ của Harry. Trong phim, chiếc hòm của Harry ở trong phòng của anh ấy và Fred và George không cần lẻn vào nhà và đánh cắp bất cứ thứ gì cả.
Chương 4: Phú quý và Cơ hàn
Cảnh Harry lắng nghe Lucius và Draco Malfoy làm ăn với Borgin đã bị cắt. Trong cảnh này, Lucius gần như dùng gậy đánh Draco tận hai lần khi bảo cậu ta không được chạm vào bất cứ thứ gì. Điều này có thể liên quan đến chiếc vòng cổ bị nguyền rủa.
Trong sách, ông Weasley là người đã sửa kính cho Harry ở Hẻm Xéo, nhưng trong phim, Hermione sửa chúng và việc cô bé sử dụng phép thuật ở ngoài Hogwarts khi chưa đủ tuổi không bị Bộ pháp thuật xử phạt. Mặc dù sau đó nó được tiết lộ rằng Bộ Pháp thuật chỉ biết nơi có phép thuật được sử dụng chứ không phải ai đang sử dụng phép thuật.
Khi gặp nhau ở Hẻm Xéo, Hermione đã tỏ ý chê bai Lucius Malfoy vì không sử dụng tên của Voldemort. (Trong hai phần phim đầu tiên, Hermione không hề sợ hãi cái tên Voldemort, nói điều này không hề khó khăn trong phần đầu tiên) Trong sách, Hermione không bao giờ sử dụng cái tên Voldemort cho đến cuốn tiểu thuyết thứ năm và cô cũng cần có rất nhiều can đảm để làm việc này
Chương 5: Cây liễu roi
Harry và Ron đến trường Hogwarts mà hầu như không gặp vấn đề gì trong sách, trong khi trong phim, họ suýt bị tàu tốc hành Hogwarts đâm và Harry suýt ngã ra khỏi xe.
Trong phim, Argus Filch tìm thấy Harry và Ron ở cây liễu roi và đưa họ đến văn phòng của Giáo sư Snape, nhưng trong sách, chính Snape là người đã tìm thấy Harry và Ron và đưa họ đến văn phòng của ông.
Chương 6: Gilderoy Lockhart
Có rất nhiều cảnh mà Lockhart lên mặt, tỏ ra am hiểu nhiều hơn người khác đã bị cắt bỏ trên phim như việc ông ta tỏ ra là mình hiểu biết về thảo dược hơn cô Sprout.
Khi các Pixie bị làm loạn trong lớp họccủa Lockhart, có một số khác biệt xảy ra như:
- Trong truyện một số pixies bắn thẳng qua cửa sổ, làm vỡ kính vỡ hàng ghế sau. Những con còn lại tiến hành phá hủy lớp một cách kinh khùng, lấy chai mực và xịt lên lớp, xé nhỏ sách và giấy tờ, xé hình ảnh trên tường, bỏ vào giỏ rác, lấy túi và sách và ném chúng ra ngoài cửa sổ bị đập vỡ; trong vòng vài phút, một nửa lớp học trốn dưới bàn học và Neville bị treo lên cây trèn trần. Tring khi trong phim dường nhưu tụi Pixie đỡ quậy phá hơn hẳn.
- Trong tiểu thuyết, Harry, Ron và Hermione gần như đang ở cửa và chuẩn bị trốn khỏi lớp nhưng Lockhart ngăn họ lại và yêu cầu họ cố gắng nhốt những Pixie vào lồng của. Nhưng trong phim, bộ ba chủ động để ngăn chặn lũ Pixie và Hermione đã thành công dùng bùa chú và làm bất động tất cả các Pixie.
Chương 7: Máu bùn và những tiếng thì thầm
Trong sách, Hermione chưa bao giờ nghe đến thuật ngữ ” Mudblood ” và cũng không hiểu nó có nghĩa là gì vì vậy Ron đã giải thích định nghĩa cho cô và Harry. Trong phim, dường như Ron đã mất đi vai trò đó, Hermione đã biết được từ đó có nghĩa gì và bị tổn thương sâu sắc, thậm chí cô còn cố gắng không khóc khi bị nói là máu bùn, và giải thích ý nghĩa của từ máu bùn cho Harry.
Chương 8: Tiệc tử nhật
Buổi tiệc tử nhật của Nick suýt mất đầu không được xuất hiện trong phim. Vì điều này, Harry gặp bà Norris đã hóa đá trên đường trở về sau hàng giờ bị giam giữ với Gilderoy Lockhart. Harry cũng gặp Ron và Hermione ngay trước khi tìm thấy bà Norris trong phim, trong khi trong sách, họ đã ở bên Harry suốt thời gian đó và dự tử nhật của ngài Nick suýt mất đầu.
Chương 9: Thông điệp trên tường
Trong phim, Hermione đã nói rằng chữ viết trên tường được viết bằng máu. Tuy nhiên, cuốn sách nói rằng thông điệp được viết đơn giản bằng sơn đỏ.
Bởi vì cảnh Harry lần đầu tiên nghe thấy Basilisk được chuyển đến trong lúc Harry bị cấm túc với Gilderoy Lockhart thay vì quay trở lại từ Bữa tiệc tử nhật của Nick suýt mất đầu, cuộc thẩm vấn của các giáo viên đối với Harry, Ron và Hermione đã bị thay đổi hầu như hoàn toàn.
Chương 10: Trái Bludger tai quái
Trong sách, để được cuốn sách Điều chế độc dược từ thư viện, cuốn sách có công thức của Thuốc Đa dịch, Hermione phải nhận được một ghi chú từ Gilderoy Lockhart vì nó nằm trong phần bị hạn chế của thư viện. Trong phim, cảnh này đã bị lược bỏ, và cuốn sách nằm trong phần thông thường của thư viện.
Trong sách, Draco hoàn toàn không để ý đến quả Snitch, do lúc đó anh chàng đang bận việc xỉa xói Harry và kết quả là Harry nhanh chóng bắt được quả Snitch trước khi Malfoy kịp nhận ra, nhưng trong phim, Draco đã nhìn thấy trái Snitch ngay sau khi Harry rượt theo và chúng ta có một màn rượt đuổi hoành tráng.